Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNMT3BQ9UBC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3BQ9UBC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms