Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARHGAP28Q9P2N2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms