Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMCD1Q9NZU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMCD1Q9NZU5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMCD1Q9NZU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms