Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MCM9Q9NXL9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCM9Q9NXL9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MCM9Q9NXL9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM9Q9NXL9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms