Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms