Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMPD4Q9NXE4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD4Q9NXE4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPD4Q9NXE4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD4Q9NXE4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms