Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRNAU1APQ9NX07 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNAU1APQ9NX07 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNAU1APQ9NX07 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms