Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HCFC1R1Q9NWW0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HCFC1R1Q9NWW0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HCFC1R1Q9NWW0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCFC1R1Q9NWW0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCFC1R1Q9NWW0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCFC1R1Q9NWW0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HCFC1R1Q9NWW0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms