Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC38A7Q9NVC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC38A7Q9NVC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms