Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM39AQ9NV64 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM39AQ9NV64 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM39AQ9NV64 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM39AQ9NV64 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms