Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF19AQ9NV58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF19AQ9NV58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF19AQ9NV58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF19AQ9NV58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF19AQ9NV58 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF19AQ9NV58 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF19AQ9NV58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF19AQ9NV58 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF19AQ9NV58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms