Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RRP7BPQ9NSQ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RRP7BPQ9NSQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms