Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOMER2Q9NSB8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HOMER2Q9NSB8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOMER2Q9NSB8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOMER2Q9NSB8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms