Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3GQ9NS98 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3GQ9NS98 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3GQ9NS98 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms