Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA4L2Q9NRX3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDUFA4L2Q9NRX3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA4L2Q9NRX3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms