Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG1

PRTFDC1, Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTFDC1Q9NRG1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRTFDC1Q9NRG1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRTFDC1Q9NRG1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRTFDC1Q9NRG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRTFDC1Q9NRG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRTFDC1Q9NRG1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRTFDC1Q9NRG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRTFDC1Q9NRG1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms