Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF4Q9NR80 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF4Q9NR80 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF4Q9NR80 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
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