Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM7Q9NQW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PRDM7Q9NQW5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms