Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX9Q9NQ69 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX9Q9NQ69 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX9Q9NQ69 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX9Q9NQ69 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms