Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D2AQ9NP31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D2AQ9NP31 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms