Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD4Q9HCU8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLD4Q9HCU8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD4Q9HCU8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD4Q9HCU8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD4Q9HCU8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD4Q9HCU8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLD4Q9HCU8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLD4Q9HCU8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLD4Q9HCU8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD4Q9HCU8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD4Q9HCU8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms