Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRPM3Q9HCF6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRPM3Q9HCF6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TRPM3Q9HCF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRPM3Q9HCF6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms