Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EBF2Q9HAK2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms