Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP13A3Q9H7F0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP13A3Q9H7F0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms