Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EBF3Q9H4W6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EBF3Q9H4W6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EBF3Q9H4W6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.3 ms