Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SENP3Q9H4L4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SENP3Q9H4L4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
SENP3Q9H4L4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SENP3Q9H4L4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms