Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC8Q9H0W5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC8Q9H0W5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC8Q9H0W5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC8Q9H0W5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC8Q9H0W5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC8Q9H0W5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms