Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL4Q9C0H6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL4Q9C0H6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL4Q9C0H6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms