Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASXL3Q9C0F0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASXL3Q9C0F0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASXL3Q9C0F0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASXL3Q9C0F0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASXL3Q9C0F0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASXL3Q9C0F0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASXL3Q9C0F0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASXL3Q9C0F0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASXL3Q9C0F0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms