Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPEB1Q9BZB8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms