Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
BRIP1Q9BX63 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
BRIP1Q9BX63 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
BRIP1Q9BX63 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRIP1Q9BX63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms