Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBM4Q9BWF3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM4Q9BWF3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM4Q9BWF3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM4Q9BWF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms