Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC61Q9BV99 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC61Q9BV99 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC61Q9BV99 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC61Q9BV99 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC61Q9BV99 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC61Q9BV99 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC61Q9BV99 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC61Q9BV99 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms