Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTKNQ9BST9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTKNQ9BST9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms