Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf78Q9BR46 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C20orf78Q9BR46 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms