Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FERMT1Q9BQL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
FERMT1Q9BQL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms