Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX50Q9BQ39 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX50Q9BQ39 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms