Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKP2Q99959 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP2Q99959 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP2Q99959 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms