Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRRT1Q99946 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRT1Q99946 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRT1Q99946 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1661.8 ms