Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TM9SF2Q99805 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM9SF2Q99805 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM9SF2Q99805 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms