Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LITAFQ99732 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LITAFQ99732 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 394.6 ms