Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGREF1Q99674 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGREF1Q99674 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGREF1Q99674 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms