Protein–RNA interactions for Protein: Q99619

SPSB2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB2Q99619 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPSB2Q99619 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPSB2Q99619 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPSB2Q99619 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms