Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAP1L3Q99457 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAP1L3Q99457 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms