Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN5Q96NI6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRFN5Q96NI6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN5Q96NI6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms