Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP295NLQ96MC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP295NLQ96MC4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP295NLQ96MC4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP295NLQ96MC4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms