Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC138Q96M89 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC138Q96M89 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC138Q96M89 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms