Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC114Q96M63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC114Q96M63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC114Q96M63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms