Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC17Q96LX7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC17Q96LX7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC17Q96LX7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms