Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00615Q96LM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00615Q96LM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00615Q96LM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms